Ba phygmies na lonnaitheoirí daonna bunaidh sa Ghabúin. Sa 13ú haois tháinig treibheanna Bantu isteach sa cheantar, den chuid is mó chun éalú ó naimhde nó chun talamh nua a fháil. Ba iad na Portaingéalaigh an chéad Eorpach a thug cuairt ar an talamh sa 15ú hAois. Thug siad an t-ainm gabao, nó cóta, ar an talamh mar cheap siad go raibh cruth Abhainn Komo cosúil le cóta.
Go gairid tháinig na Francaigh, na Dúitsigh, agus na Sasanaigh go dtí an Ghabúin. Bhí an ceantar ina lárionad mór do thrádáil na sclábhaithe.
Sa bhliain 1885 ghlac an Fhrainc seilbh ar an nGabúin agus rinne sí cuid den Afraic Mheánchriosach sa Fhrainc i 1910. Bheadh an Ghabúin mar chuid den ghrúpa seo go dtí 1960 nuair a ghnóthaigh sé a neamhspleáchas. Ón am sin i leith tá dhá dheachtóir uachtarán fada ag Gabon. Leon M'ba an chéad cheann agus El Hadj Omar Bongo Ondimba an dara ceann.